尿道结石患者仅在夜晚出现疼痛可能是由于睡眠时身体处于平躺状态，此时结石更容易阻塞尿道，进而引发疼痛。
因为白天人体处于站立位或者坐立位，此时身体重力的作用有助于减轻尿道结石引起的不适症状。而到了夜晚，随着睡眠的到来，人体进入休息状态，肌肉松弛，尿道张力降低，结石容易滑动，从而诱发疼痛。此外，夜晚迷走神经兴奋性增高，可能通过神经反射加重疼痛感。
如果患者存在膀胱炎、输尿管炎等疾病，在夜间炎症因子刺激下，也可能会导致上述现象的发生。
针对尿道结石的治疗，应避免剧烈运动以减少结石移动，同时注意多饮水促进排泄。若疼痛加剧或伴有血尿等情况，应及时就医以便获得适当的治疗。
